长链非编码RNA芯片
ncRNA研究的重要一步是发现与特定疾病相关的lncRNA。传统的lncRNA筛选方法（SELEX等）效率低下，假阳性率高。而基因芯片具有覆盖全面、高效、准确的特点
illumina人类全基因组表达谱芯片
每chip可同时检测8个样本，每个样本分析超过24500个转录子，基因信息来自于NCBI RefSeq database（Build 36.2，Release 22）
illumina全基因组snp分型芯片human610-quad
Human610-quad在一张芯片上可平行进行4个样品的检测，显著的增加了样本输出信息量，减少了实验操作中的误差。Human610-quad广泛的采用了HumanHap550芯片的内容，以及额外增加了60000个遗传标记。Human610
基因分型芯片-Illumina小鼠和人的连锁分析
连锁分析芯片是进行疾病连锁分析的最佳工具，可以从家系基因型表现型和单基因型连锁不平衡中发现连锁关系。人类连锁分析芯片实验表明其成功率为99.8%，重复性>99.9%。
Illumina BeadXpress基因分型芯片
BeadXpress平台采用灵活的GoldenGate技术，对样本进行96-384个SNP的分型，分析Veracode数字微码芯片。可一次进行多孔分析，最多1536孔。